Biyobilimler Enstitüsü Direktörü Nevan Krogan'dan meme kanseri hakkında önemli açıklamalar
Meme kanseri, COVID-19 ve otizm birbiriyle ilgisiz görünebilir, ancak bazı şaşırtıcı bağlantıları vardır. Meme kanserinde mutasyona uğrayan aynı genlerden bazıları COVID-19 tarafından da ele geçirilir ve kanserde mutasyona uğrayan diğer bazı genler de otizmle ilişkilendirilir.
UCSF Kantitatif Biyobilimler Enstitüsü Direktörü Nevan Krogan'ı, çok çeşitli hastalıklarda büyük rol oynayan bir avuç genin etkilerini ayrıntılı olarak incelemeye yöneltti. Genlerin planları olduğu proteinlere dayanır. Bir gen mutasyona uğradığında, proteini de değişir. Aynı zamanda Gladstone Enstitüleri'nde kıdemli araştırmacı olan Krogan, şu açıklamaları yaptı:
- Genomumuz nispeten statiktir, ancak proteinler öyle değildir. "Zaman içinde değişen farklı bağlamlarda sürekli olarak diğer proteinlerle etkileşim halindedirler." Birçok durum düzinelerce mutasyon içeriyor
On yıldan uzun bir süre önce Krogan, kanser, otizm ve bulaşıcı hastalıklardaki bir dizi mutasyon boyunca sağlıklı ve hastalıklı hücrelerde bu protein-protein etkileşimlerinin veya PPI'ların binlercesini karşılaştıran 'hücre haritaları' oluşturmak için sofistike nicel yaklaşımlar kullanmaya başladı.
On yıldan uzun bir süre önce Krogan, kanser, otizm ve bulaşıcı hastalıklardaki bir dizi mutasyon boyunca sağlıklı ve hastalıklı hücrelerde bu protein-protein etkileşimlerinin veya PPI'ların binlercesini karşılaştıran 'hücre haritaları' oluşturmak için sofistike nicel yaklaşımlar kullanmaya başladı. Bu PPI'lara odaklanmanın, mutasyonların hücre işlevlerini nasıl bozduğunu aydınlatabileceğine ve daha güvenli ve daha etkili tedaviler için giriş noktalarını ortaya çıkarabileceğine inanıyor.
Krogan ile ABD ve dünyanın dört bir yanındaki araştırmacılar arasındaki işbirlikleri, farklı genlerdeki mutasyonların bazen aynı hücresel yolları nasıl bozduğunu ortaya çıkardı ve genetik düzeyde oldukça farklı görünebilen hastalıklar arasındaki bağlantıları aydınlattı.
Diğer durumlarda, aynı gen birden fazla hastalıkta rol oynar: A noktasındaki bir mutasyon kansere katkıda bulunurken, B noktasındaki bir mutasyon psikiyatrik bir bozukluğa yatkınlık yaratabilir.
Krogan, şu açıklamaları yaptı:
- Genomun Aşil topuklarını buluyoruz. "DNA'nın ötesine geçerek ve bu protein etkileşim ağlarına bakarak, daha önce var olduğunu bile bilmediğimiz noktaları birleştirebiliyoruz."
Krogan, sadece bu mutasyonların her birinin hastalığa nasıl yol açtığını değil, aynı zamanda çeşitli yollarının sağlıklı hücrelerde nasıl oynadığını da kataloglayarak, bu mutasyonların her birinin hücrenin protein etkileşimlerini raydan çıkardığı kesişme noktasını belirlemesine olanak sağladı.
Gen haritaları, belirli bir hastanın genlerinde bulunan mutasyonlardan kaynaklanan proteinlere dayalı bir prognoz sağlamaya yardımcı olabilir; klinisyenlerin bir tedaviyi diğerine tercih etmesine yardımcı olabilir; ve bir ilacın diğer sağlıklı hücre işlevlerine müdahale etmeden bir hastalığı nerede durdurabileceğini ortaya çıkarabilir.
HASTALIĞA YENİ BAKIŞ
Krogan protein haritalarını bilgisayarda oluşturulmuş bir coğrafi haritaya benzetiyor. Geniş bir alanı görmek için uzaklaştırabilir, ardından yerel ayrıntıları görmek için yakınlaştırabilir, ardından bu ayrıntıları bağlama yerleştirmek için tekrar uzaklaştırabilirsiniz. Krogan, bu farklı ayrıntı düzeylerini görebilmenin, araştırmacıların beklenmedik uygulamalar için test edilebilecek FDA onaylı ilaçları belirlemelerine potansiyel olarak yardımcı olabileceğini söyledi. Krogan şu açıklamalarda bulundu:
-Bu hücre haritaları, hastalıklara ve ilaç keşfine bakmanın tamamen yeni bir yoludur.
Nevan Krogan sonrasında şu ifadeleri ekledi:
- Altta yatan bu biyolojiyi anladığımızda, hastalığa saldırmak çok daha kolay hale geliyor. Bir dizi hastalık için genomdan kliniğe uzanan bu köprüyü inşa etmek üzere mükemmel bir konumdayız.
Kaynak: ucsf.edu